Najlepiej dla kart sieciowych komputerów, które są podłączone bezpośrednio, stosuj osobną adresację sieci(osobną podsieć). Jezeli będziesz chciał zestawić połączenia bezpośrednie miedzy kompami, to odwołuj się przez ich adresy IP z podsieci, a nie przez nazwy NetBios'owe. W takim wypadku, cały ruch będzie szedł bezpośrednio między nimi, a nie przez router (switch). Jezeli będziesz miał problem z adresacją dla podsieci, to napisz jaka adresacja jest dla podsieci z routerem (łącznie z maską), a ja podam ci przykład podsieci dla połączenia bezpośredniego. Innym rozwiązaniem jest zakup switcha gigabit. W takim wypadku do tego switcha podłączysz router oraz te dwa kompy. Rozwiązanie takie eliminuje również potrzebę posiadania lub włączania dodatkowych (drugich) kart sieciowych w obydwu komputerach - wystarczy połączenie przez jedną kartę. Moim zdaniem rozwiązanie drugie jest lepsze, choć nie znam wszyskich parametrów i potrzeb działania twojej sieci, np. bezpieczeństwo i poufność danych (np. praca w odrębnej podsieci może zagwarantować na poziomie logicznym separację od transmisji odbywającej się poprzez switch w routerze).